流式細胞術(shù)是現代生物學(xué)研究中的一項重要技術(shù)。它zui初主要用于細胞的熒光分析以及標有熒光抗體的細胞分選，當然，這仍是現階段的主要應用。但zui近，流式細胞儀的應用范圍正在迅速擴大。在介紹性的評論中，Kalisky和Quake討論了流式細胞儀在單細胞分析中的作用，并談及了它在基因組測序和基因表達中的新興作用。其中，Navin等的一篇文章介紹了從腫瘤細胞中分離單個(gè)流式分選的核，接著(zhù)進(jìn)行全基因組擴增和單細胞基因組的測序，以研究腫瘤發(fā)展。而B(niǎo)rind'Amour則描述了另一種流式細胞學(xué)方法，它通過(guò)FISH對重復基因組DNA進(jìn)行分析。

在甲基化分析中，流式細胞儀已應用在癌癥生物標志物的尋找上。通過(guò)定量臨床血漿和糞便樣品中的DNA甲基化來(lái)尋找生物標志物，如Li等的文章。盡管流式細胞儀在臨床和預臨床研究中的流行，但這項技術(shù)的復雜度也限制了它在監控臨床試驗中的應用。在一篇發(fā)表在《Nature Immunology》上的評論中，Maecker等提出了一個(gè)流程，讓使用流式細胞儀監控的多中心臨床試驗的實(shí)驗可變性降至zui低程度。流式細胞儀目前不僅僅用于哺乳動(dòng)物細胞的研究。根據Stoeckius等，它還用于分期的線(xiàn)蟲(chóng)胚胎的篩選，以分析RNA表達。而Suzuki等則通過(guò)反復交配和單缺失株的富集創(chuàng )建出帶有多個(gè)缺失的釀酒酵母。另外，Mayer等采用熒光激活細胞分選來(lái)富集細胞特異的適體（aptamer）。

《Nature Methods》的主編Daniel Evanko認為，這些例子僅僅是目前進(jìn)展中的一部分，無(wú)疑流式細胞術(shù)將繼續發(fā)展，作為新技術(shù)被采用，并開(kāi)發(fā)出新的應用。之前，流式細胞儀一直被認為是精密復雜的儀器，需訓練有素的專(zhuān)人操作，且價(jià)值不菲，一般實(shí)驗室只能望而興嘆。但近年來(lái)一些主流生物技術(shù)企業(yè)相繼推出了新型流式細胞儀，不單將原本需要一支工程師隊伍進(jìn)行安裝的大型設備壓縮成為可以單人運送的緊湊型儀器，而且操作更加簡(jiǎn)單，價(jià)格也更加實(shí)惠。