一、培訓班上課內容 
      上課內容涵蓋“基因組學(xué)―蛋白質(zhì)組學(xué)―系統生物學(xué)”的研究方法、技術(shù)思路、前沿進(jìn)展及其在各生物學(xué)科中的應用。 
核心課程包括： 
1. 基因組的比較研究、DNA測序技術(shù)原理與進(jìn)展（講課人：于 軍 教授） 
2. 轉錄組的測定與分析、大規模測序方法及應用、微生物基因組學(xué)、基因組學(xué)與醫學(xué)（講課人：胡松年教授） 
3. 系統生物學(xué)建模分析及高通量分析技術(shù)應用（講課人：楊軍、陳銘教授等） 
4. 蛋白質(zhì)組學(xué)概論及應用 （講課人：鐘伯雄教授）

二、培訓班上機內容 
      上機實(shí)習課采用 “跟我學(xué)”方式，學(xué)習實(shí)踐各類(lèi)基礎生物信息學(xué)軟件，每人一臺PC機跟著(zhù)大屏幕一步步學(xué)會(huì )基因組、蛋白質(zhì)組學(xué)數據分析的基本方法。

主要內容如下： 
實(shí)習一： 基因組數據注釋和功能分析
      通過(guò)序列比對工具BLAST的學(xué)習，了解基因功能注釋的原理；介紹多序列聯(lián)配工具ClustalX及分子進(jìn)化分析軟件MEGA4，掌握系統發(fā)生樹(shù)繪制的基本方法，認識基因復制在進(jìn)化上的功能；學(xué)習基因序列分析常用的數據庫和軟件。 
實(shí)習二： 轉錄組數據分析
      介紹轉錄組數據分析的基本流程及其原理；通過(guò)對tophat、cufflinks、R等轉錄組數據分析工具的介紹及演示，了解基于二代測序數據的轉錄組分析流程及常用分析方法； 利用kegg、GOstat、DAVID等在線(xiàn)工具挖掘轉錄組數據的生物學(xué)意義。 
實(shí)習三：系統生物學(xué)軟件實(shí)習-----網(wǎng)絡(luò )結構顯示與分析 
      利用Cytoscape系統生物學(xué)分析軟件，分析蛋白－蛋白相互作用，展示分子網(wǎng)絡(luò )系統，并與基因表達等數據整合。 
實(shí)習四：蛋白質(zhì)結構與功能分析 
      從數據庫搜索感興趣的蛋白質(zhì)氨基酸序列開(kāi)始，接著(zhù)對蛋白質(zhì)基本理化性質(zhì)、二級結構、和三維空間結構和序列模體進(jìn)行分析，預測目標蛋白的生物功能。 
實(shí)習五： 蛋白質(zhì)組質(zhì)譜分析 
      使用X！Tandem、Mascot、Sequest等軟件鑒定蛋白質(zhì)質(zhì)譜數據，將質(zhì)譜結果匹配到蛋白質(zhì)組數據庫鑒定蛋白；使用TPP軟件包進(jìn)行統計學(xué)分析和優(yōu)化檢索結果練習。

三、培訓對象 

無(wú)生物信息學(xué)背景，希望了解生物信息學(xué)的學(xué)員； 
計劃開(kāi)展各類(lèi)組學(xué)研究的科研人員； 
已有組學(xué)數據需了解分析方法的研究人員； 
有志從事生物信息學(xué)相關(guān)工作的學(xué)生或者技術(shù)人員。